Savjeti za otkrivanje COVID-19

Kako bi podržali otkrivanje novog koronavirusa (COVID-19) i istraživanje i razvoj cjepiva, američki centri za kontrolu i prevenciju bolesti (CDC) i kineska vlada dovršili su sekvenciranje novog genoma koronavirusa i rezultate dostavili američkom NCBI GenBank ® baza podataka]. Nedavno je IDT primio upite istraživača širom svijeta o novom kompletu za otkrivanje koronavirusa. Sledi kratak opis.

Američki centri za kontrolu i prevenciju bolesti

Američki centri za testiranje i kontrolu prevencije bolesti * Cilja različite lokacije na COVID-19 nukleokapsidnom genskom proteinu (N-genu). Tri seta primera / sonde u ovom kompletu moraju se pokrenuti istodobno s unutarnjom kontrolom koja cilja ljudski RNase P gen. Za svaki uzorak pacijenta potrebno je ukupno 4 qPCR testova.

1. Kit za otkrivanje koristi jednostepenu qPCR reakciju (to jest, reverzna transkripcija i slijedeće qPCR reakcije su završene u istom koraku);

2. Svi 3 N-gen testovi mogu se smatrati pozitivnim rezultatom samo kada Cq 0010010 lt; 35;

3. Ključna je reakcija interne kontrole RNase P. Cq 0010010 gt; 3 5 znači da vađenje uzorka nije dobro i eksperiment treba ponoviti;

Molimo pogledajte najnovije američke centre za kontrolu i prevenciju bolesti COVID-19 RT-PCR laboratorijski vodič za ispitne metode za relevantne dokumente i eksperimentalne protokole.

Usporedba s ostalim testnim setovima

Svjetska zdravstvena organizacija (WHO)

Eksperimentalni program Svjetske zdravstvene organizacije razlikuje se od eksperimentalnog programa američkih Centara za kontrolu i prevenciju bolesti. Svjetska zdravstvena organizacija preporučuje tri reakcije qPCR-a kako bi potvrdili da li je COVID-19 zaražen. Iako je ovo kompletan set eksperimentalnih protokola, ne postoji američka metoda testiranja CDC-a koja je brža jer zahtijeva tri uzastopna ispitivanja i prije sljedećeg ispitivanja mora se primijetiti pozitivan rezultat. Eksperimentalni protokol testira se sljedećim redoslijedom:

1. Coronavirus E-gen

2. RdRP gen: ciljanje SARS koronavirusa i ostalih koronavirusa povezanih sa šišmišom

3. RdRP gen: ciljanje COVID-19

Kineski centar za kontrolu i prevenciju bolesti

Komplet za otkrivanje Kineskog centra za kontrolu i prevenciju bolesti preporučuje upotrebu 2 setova prajmera / sondi. Grupa 1 cilja ORF 1 ab, a grupa 2 se koristi za potvrđivanje N-gena COVID-19.

Kontrolna grupa

Preliminarna analiza elektroničke simulacije pokazuje da je kombinacija IDT uzorka pozitivnog kontrolnog gena N i gena za ispitivanje CDC-a u SAD-u slična upotrebi kompleta temeljnih / temeljnih sondi kineskog CDC-a, Ministarstva zdravlja Tajlanda i HKU-a. Dobiveni rezultati eksperimentom su konzistentni. To se, naravno, temelji na elektroničkom istraživanju simulacije, pa se preporučuje korisnicima da odabrani komplet ovjere u vlastitoj laboratoriji.

Za više informacija posetite www.idtdna.com/pages/landing/coronavirus-research-reagents